BH13.13/pubdictionaries

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(辞書を用いたテキスト処理)
(辞書を用いたテキスト処理)
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* 実データ
* 実データ
** バクテリアゲノム辞書(鈴木さん)
** バクテリアゲノム辞書(鈴木さん)
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*** バクテリア遺伝子の機能アノテーションの辞書を作成。Staphylococcusのコンプリートゲノム配列に含まれるタンパク質コード配列(CDS)のアノテーション(EC番号、gene、product名など)を複数データベース(COG, JCVI, SEED, Genbank)から集めた。
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*** 参考文献: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22272658 "Comparative genomic analysis of the genus Staphylococcus including Staphylococcus aureus and its newly described sister species Staphylococcus simiae."]
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** 疾患の症状の日本語辞書(森田さん)
** 疾患の症状の日本語辞書(森田さん)
* システム
* システム

2014年1月30日 (木) 07:59時点における版

辞書を用いたテキスト処理


    • 疾患の症状の日本語辞書(森田さん)
  • システム
  • 流れ
    • PubDictionariesに辞書をUpload
      • (文字列, ID, label)のCSV
      • 辞書に基づくテキストアノテーションREST serviceが生成される
    • PubAnnotationに文書を入れる
      • 今現在PubMed, PMCの論文を入れるのができる。
      • First Authorsもできるようにした。
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