糖鎖データベース

糖鎖のRDF化

糖鎖の連携

メタボロームと糖鎖

(2014/1/27)
有田さんのフラボノイドのMolfileをWURCSへ変換（山田）。
現時点のWURCS精製プログラムでは、FLのMolfileの糖の立体を考慮できない問題がある。
(2014/1/28)
フラボノイドのIDとWURCSをDBへ登録（山田）
結果：
1444種類のWURCSが生成確認（山田）
例）WURCS=1.0-BH13.13/2,1/[1X1Xh|1,5|3*OCC/3=O][1X12Xh|1,5]1+1,2+6
FLidは、2635個見つかった。（山田）

KAApSAcKデータの中の糖質を見つける（山田）
ハッカソン中にMol2WURCSにKNApSAcKの最初の１千個(5万件のmolデータ)を当ててみる。
結果：

メタボロームデータのアノテーションツールとしての可能性を検討

メタゲノムと糖鎖

糖鎖構造標準化

脂質

back to BH13.13

BH13.13/glycodb

提供：TogoWiki

目次