BH13.13/glycodb
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目次 |
糖鎖データベース
糖鎖のRDF化
糖鎖の連携
メタボロームと糖鎖
(2014/1/27)
有田さんのフラボノイドのMolfileをWURCSへ変換(山田)。
現時点のWURCS精製プログラムでは、FLのMolfileの糖の立体を考慮できない問題がある。
(2014/1/28)
フラボノイドのIDとWURCSをDBへ登録(山田)
結果:
1444種類のWURCSが生成確認(山田)
例)WURCS=1.0-BH13.13/2,1/[1X1Xh|1,5|3*OCC/3=O][1X12Xh|1,5]1+1,2+6
FLidは、2635個見つかった。(山田)
KAApSAcKデータの中の糖質を見つける(山田)
ハッカソン中にMol2WURCSにKNApSAcKの最初の1千個(5万件のmolデータ)を当ててみる。
結果:
メタボロームデータのアノテーションツールとしての可能性を検討
メタゲノムと糖鎖
糖鎖構造標準化
脂質
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