BH12.12/GGGenome

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== テーマ ==
== テーマ ==
ゲノム等の塩基配列検索に特化したサービス [http://GGRNA.dbcls.jp/genome/ GGGenome] の構築
ゲノム等の塩基配列検索に特化したサービス [http://GGRNA.dbcls.jp/genome/ GGGenome] の構築
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* システムは内藤が開発しているRefSeqの全文検索システム [http://GGRNA.dbcls.jp/ GGRNA] の流用
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* 名称はGGRNAを s/RNA/Genome/ したもの → GGGenome (ゲゲゲノム)
== 開発の動機 ==
== 開発の動機 ==
ゲノムRDFやINSDC/DDBJオントロジーのプロジェクトと連携して、塩基配列(の断片)を扱える仕組みをつくれないか?
ゲノムRDFやINSDC/DDBJオントロジーのプロジェクトと連携して、塩基配列(の断片)を扱える仕組みをつくれないか?
== 概要 ==
== 概要 ==
* GGGenome (http://GGRNA.dbcls.jp/GGGenome/) のトップページを参照。
* GGGenome (http://GGRNA.dbcls.jp/GGGenome/) のトップページを参照。
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* システムは内藤が開発しているRefSeqの全文検索システム [http://GGRNA.dbcls.jp/ GGRNA] の流用
 
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* 名称はGGRNAを s/RNA/Genome/ したもの → GGGenome (ゲゲゲノム)
 
== BH12.12での作業 ==
== BH12.12での作業 ==
* REST APIのインターフェースを作成
* REST APIのインターフェースを作成

2012年12月21日 (金) 07:14時点における版

目次

テーマ

ゲノム等の塩基配列検索に特化したサービス GGGenome の構築

  • システムは内藤が開発しているRefSeqの全文検索システム GGRNA の流用
  • 名称はGGRNAを s/RNA/Genome/ したもの → GGGenome (ゲゲゲノム)

開発の動機

ゲノムRDFやINSDC/DDBJオントロジーのプロジェクトと連携して、塩基配列(の断片)を扱える仕組みをつくれないか?

概要

BH12.12での作業

メンバー

  • 内藤
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