BH12.12/stanza takehara

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東工大　SPARQL Endpoint

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作成したスタンザ用SPARQLクエリ

  • Metagenome/Meta16S Sample List
  • environment attributes
  • organism_info (Taxon general)
  • metagenome cross reference
  • 山本さん：disease information（あるPDOタームに関連する菌株名、病名、感染タイプ（日和見かどうか）、株タイプ（無毒株かどうか）、上位階層）
  • 山本さん：pathogen information（ある菌株が引き起こす病名、感染タイプ（日和見かどうか）、株タイプ（無毒株かどうか）、上位階層）

ヒトメタゲノム論文からのメタデータ抽出（マニュアル）

「/mw/BH12.12/stanza_takehara」より作成