BH12.12/SPARQLthon7/GOLD MPO

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MPO (Microbial Phonetype Ontology) 現状

  • 2013/4/18 現在、クラスとプロパティあわせて、158ターム。
  • BioPortal に、MPO v3 alpha として登録済。

GOLD 表現型情報のLOD化 現状

表現型 トリプル数
Cell shape18,036
Cell arrangement14,724
Oxygen requirement17,946
Motility16,782
pH2,106
Temperature range classification20,106
Temperature9,882
Salinity660
Energy source7,686

Sample 情報LOD化の検討

  • MCLでは、Sample 情報を記述する語彙が準備されているので、その構造を検討した
  • GCM minimum data sets, BioSample, MIGS などとの対応を見て、どのようにオントロジーを構築したらよいか？

MCLSample.002.png

「/mw/BH12.12/SPARQLthon7/GOLD_MPO」より作成