TogoGenomeTextSearch/v201502

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目次

概要

データ生成手順等は以下のページ参照
TogoGenomeテキスト検索

対象スタンザ

Environment(MEO)

対象スタンザ

対象外スタンザ

  • environment_environmental_ontology_stanza サンプルページ --可視化スタンザ。
  • environment_geographical_map_stanza [ サンプルページ] --可視化スタンザ。
  • environment_inhabitants_statistics_nano_stanza [ サンプルページ] --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • environment_inhabitants_statistics_stanza サンプルページ --表示は数値データのみ。
  • environment_organism_distribution_on_ph_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • environment_organism_distribution_on_temperature_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • environment_taxonomic_composition_stanza サンプルページ --可視化スタンザ。
  • environment_top_level_symbolic_image_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。

Organism(Taxonomy)

対象スタンザ

対象外スタンザ

  • genome_plot_stanza サンプルページ --可視化スタンザ。
  • lineage_information_stanza サンプルページ --上位の生物種名を検索する。Bacteria等上流のTaxonomyは文字数が膨大になるため非対象
  • organism_gc_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • organism_gene_number_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • organism_genome_size_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • organism_jbrowse_stanza サンプルページ -- 可視化スタンザ。
  • organism_microbial_cell_shape_nano_stanza [サンプルページ] -- ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • organism_ph_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • organism_related_disease_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • taxonomy_ortholog_profile_stanza サンプルページ --可視化スタンザ。MBGDのエンドポイントのデータを使用しており、一括出力が困難?

Phenotype(MPO)

対象スタンザ

対象外スタンザ

Medium

対象スタンザ

対象外スタンザ

Gene

対象スタンザ

対象外スタンザ

  • gene_length_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • genome_jbrowse_stanza サンプルページ --可視化スタンザ。
  • nucleotide_sequence_stanza サンプルページ --シーケンスデータのみのスタンザ。
  • protein_3d_structure_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • protein_attributes_stanza サンプルページ --検索対象の文字列なし。
  • protein_ec_number_nano_stanza サンプルページ --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • protein_general_annotation_stanza サンプルページ
  • protein_orthologs_stanza サンプルページ --MBGDのエンドポイントのデータを使用しており、一括出力が困難?
  • protein_pfam_plot_stanza [ サンプルページ] --可視化スタンザ。
  • protein_references_timeline_nano_stanza [ サンプルページ] --ナノスタンザ。可視化スタンザ。
  • protein_sequence_stanza サンプルページ --検索対象の文字列なし。
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