SPARQLthon19/TogoGenome
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目次 |
RDF モデル
- ゲノム RDF 真核対応
- RDF サミットでゲノムアノテーションの RDF モデル、URI、オントロジーなどの共通化を進める
- TPP(植物統合および微生物統合)との連携、ゲノムRDFデータモデルの共用のためにコンバーター共有refseq2ttl.rb v8
- https://gist.github.com/ktym/5547403 実行のために https://gist.github.com/3985701 https://gist.github.com/4146256 を refseq2ttl/に以下のjsonファイルを配置する
ruby scripts/refseq2ttl.rb GCF_000001735.3/* > genome.ttl
- コンバーター
TogoWS
TogoStanza の機能拡張
- テキスト検索の API を整備
- スタンザ用のキーワード検索を行う SPARQL も実装
- 検索結果はそのキーワードにヒットするスタンザの URL と引数を返す
- スタンザのメタデータを整備
- ヘルプから、引数, プロバイダ, DB, 説明, ライセンス などを
- スタンザの内容のダウンロード機能 (text, image etc.)
- スタンザのポータルサイト整備
- スタンザサーバを公開すると、メタデータが togostanza.org に送られてレポジトリに追加される?(カテゴリ分け)
- 検索結果のスタンザを列挙して表示するしくみ (togogenome.org などアプリ側でもつ?)
- 残課題
- アクセスコントロール - ワンタイムの ID を発行?
- Nanopub の入力フォーム
- SPARQL インジェクション対策
MSS
- キーワード検索 SPARQL の整備
EMS
- キーワード検索やメタデータ用の API を拡張
- ID リゾルバ、ID コンバータ - EdgeStore の整備も?
- togogenome.org の tab 化
- 森さんのリクエスト?