SPARQLthon19/TogoGenome

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目次

RDF モデル

  • ゲノム RDF 真核対応
  • RDF サミットでゲノムアノテーションの RDF モデル、URI、オントロジーなどの共通化を進める
 ruby scripts/refseq2ttl.rb GCF_000001735.3/* > genome.ttl
  • コンバーター

TogoWS


TogoStanza の機能拡張

  • テキスト検索の API を整備
    • スタンザ用のキーワード検索を行う SPARQL も実装
    • 検索結果はそのキーワードにヒットするスタンザの URL と引数を返す
  • スタンザのメタデータを整備
    • ヘルプから、引数, プロバイダ, DB, 説明, ライセンス などを
    • スタンザの内容のダウンロード機能 (text, image etc.)
  • スタンザのポータルサイト整備
    • スタンザサーバを公開すると、メタデータが togostanza.org に送られてレポジトリに追加される?(カテゴリ分け)
    • 検索結果のスタンザを列挙して表示するしくみ (togogenome.org などアプリ側でもつ?)
  • 残課題
    • アクセスコントロール - ワンタイムの ID を発行?
    • Nanopub の入力フォーム
    • SPARQL インジェクション対策

MSS

  • キーワード検索 SPARQL の整備

EMS

  • キーワード検索やメタデータ用の API を拡張
  • ID リゾルバ、ID コンバータ - EdgeStore の整備も?
  • togogenome.org の tab 化
  • 森さんのリクエスト?
個人用ツール