BH12.12/stanza titech/taxon general

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Taxon General

  • スタンザ概要--------------------------
    ある系統に関する基本情報のスタンザ
  • 入力----------------------------------
    NCBI Taxon ID
  • 出力----------------------------------
変数名説明URI or literal
?ncbitaxon_idNCBI Taxon IDURI
?ncbitaxon_labelNCBI Taxon名literal
?ncbitaxon_rankタクソン名URI
?ncbitaxon_superclass親クラスURI
?dbxrefliteral
  • 使用グラフ----------------------------
    ncbitaxon.owl
  • メモ----------------------------------
  • SPARQL query--------------------------

例:NCBITaxon_584626に関する情報

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX srs: <http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?sample=>
PREFIX envo: <http://purl.bioontology.org/ontology/ENVO/>
PREFIX gaz: <http://purl.org/obo/owl/GAZ#>
PREFIX fma: <http://sig.uw.edu/fma#>
PREFIX dc: <http://purl.org/dc/elements/1.1/>
PREFIX ncbitaxon: <http://purl.org/obo/owl/NCBITaxon#>
PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/>
PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX go: <http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#>


SELECT  ?ncbitaxon_id ?ncbitaxon_label ?ncbitaxon_rank ?ncbitaxon_superclass ?dbxref 
WHERE{
	ncbitaxon:NCBITaxon_584626	rdfs:label	?ncbitaxon_label.
	?ncbitaxon_id	rdfs:label	?ncbitaxon_label.

	OPTIONAL{
		?ncbitaxon_id go:hasDbXref/rdfs:label ?dbxref.
	}
	OPTIONAL{
		?ncbitaxon_id	 <has_rank>	?ncbitaxon_rank.	
	}
	OPTIONAL{
		?ncbitaxon_id	rdfs:subClassOf	?ncbitaxon_superclass.
	}
}

実行結果

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