BH12.12/stanza titech/metagenome sample list revised
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metagenome sample list / meta16S sample list
- スタンザ概要--------------------------
- ある環境から採取されたメタゲノムサンプルのリスト
- ある環境から採取されたメタ16Sサンプルのリスト
- 入力----------------------------------
- MEO_ID
- 出力----------------------------------
| 変数名 | 説明 | URI or literal |
|---|---|---|
| ?SRS_ID | SRS ID | URI |
| ?MEO_term_list | MEO termの列挙 | literal |
- 使用グラフ----------------------------
- メモ----------------------------------
- MEO_0000437はsampledFromEnv
- MEO_0000441はinvestigation_type
- SPARQL query--------------------------
例：メタデータにMEO_0000054（feces）を持つメタゲノムデータのリスト
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX srs: <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/>
PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/>
PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
SELECT DISTINCT
?SRS_ID (GROUP_CONCAT(?MEO_label ; SEPARATOR = " , ")AS ?MEO_term_list)
FROM <http://microbedb.jp/ncbitaxon/>
FROM <http://microbedb.jp/srs/>
FROM <http://microbedb.jp/meo/>
WHERE{
?SRS_ID meo:MEO_0000441 "metagenome".
#investigation_type
?SRS_ID meo:MEO_0000437 ?MEO_ID.
?MEO_ID rdfs:label ?MEO_label.
}order by ?SRS_ID
