BH12.12/stanza titech/metagenome sample list revised

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metagenome sample list / meta16S sample list

  • スタンザ概要--------------------------
    ある環境から採取されたメタゲノムサンプルのリスト
    ある環境から採取されたメタ16Sサンプルのリスト
  • 入力----------------------------------
    MEO_ID
  • 出力----------------------------------
変数名説明URI or literal
?SRS_IDSRS IDURI
?MEO_term_listMEO termの列挙literal
  • 使用グラフ----------------------------
  • メモ----------------------------------
MEO_0000437はsampledFromEnv
MEO_0000441はinvestigation_type
  • SPARQL query--------------------------

例:メタデータにMEO_0000054(feces)を持つメタゲノムデータのリスト

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX srs: <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/>
PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/>
PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>

SELECT DISTINCT
?SRS_ID (GROUP_CONCAT(?MEO_label ; SEPARATOR = " , ")AS ?MEO_term_list)

FROM <http://microbedb.jp/ncbitaxon/>
FROM <http://microbedb.jp/srs/>
FROM <http://microbedb.jp/meo/>

WHERE{
	?SRS_ID	meo:MEO_0000441	"metagenome".
			#investigation_type
		?SRS_ID	meo:MEO_0000437	?MEO_ID.
		?MEO_ID	rdfs:label	?MEO_label.
	
}order by ?SRS_ID
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