BH12.12/stanza titech/metagenome cross reference

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Metagenome Cross Reference

  • スタンザ概要--------------------------
    あるメタゲノム/メタ16Sサンプルの、他DBへのLink情報
  • 入力----------------------------------
    SRS ID
  • 出力----------------------------------
変数名説明URI or literal
?SRS_IDSRSのIDURI
?SRS_labelSRSのラベルliteral
  • 使用グラフ----------------------------
    meo_sample.ttl.Changed3
  • メモ----------------------------------
  • SPARQL query--------------------------

例:SRS182953のリンク情報

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX srs: <http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?sample=>
PREFIX envo: <http://purl.bioontology.org/ontology/ENVO/>
PREFIX gaz: <http://purl.org/obo/owl/GAZ#>
PREFIX fma: <http://sig.uw.edu/fma#>
PREFIX dc: <http://purl.org/dc/elements/1.1/>
PREFIX ncbitaxon: <http://purl.org/obo/owl/NCBITaxon#>
PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/>
PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>

SELECT ?SRS_ID ?SRS_label
WHERE{
	srs:SRS182953	rdfs:label ?SRS_label.
	?SRS_ID	rdfs:label ?SRS_label.
}

実行結果

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