BH12.12/SPARQLthon14/TogoStanza

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TogoStanza の作り方

  • Ruby 2.0 をインストールする (Mac OS X 10.9 Mavericks では標準添付されています)
  • RubyGems で gem install togostanza を実行

20131031-TogoGenome.013.png 

<!DOCTYPE html>
<head>
<title>TogoStanza example</title>
<script type="text/javascript" src="http://code.jquery.com/jquery-latest.min.js"></script>
<script src="http://togogenome.org/stanza/assets/stanza.js" type="text/javascript"></script>
</head>
<body>
< div data-stanza="http://togogenome.org/stanza/protein_names" data-stanza-tax-id="103690" data-stanza-gene-id="alr4977"></div>
</body>


20131031-TogoGenome.014.png 20131031-TogoGenome.015.png 

class MyAwesomeStanza < TogoStanza::Stanza::Base
 property :features do |gene_id|
 query("http://ep.dbcls.jp/sparql7dev", <<-SPARQL.strip_heredoc)
 PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
 PREFIX insdc: <http://insdc.org/owl/>
 SELECT DISTINCT ?feature_product ?feature_gene
 WHERE {
     ?s rdfs:label "#{gene_id}" .
     ?s insdc:feature_product ?feature_product .
     ?s insdc:feature_gene ?feature_gene .
  }
  SPARQL
 end
end

20131031-TogoGenome.016.png

「/mw/BH12.12/SPARQLthon14/TogoStanza」より作成