BH12.12/GGGenome

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目次

テーマ

ゲノム等の塩基配列検索に特化したサービス GGGenome の構築と REST API の提供

  • システムは内藤が開発しているRefSeqの全文検索システム GGRNA の流用
  • 名称はGGRNAを s/RNA/Genome/ したもの → GGGenome (ゲゲゲノム)
  • 完全一致に近い配列をかなり高速に検索できる

開発の動機

ゲノムRDFやINSDC/DDBJオントロジーのプロジェクトと連携して、塩基配列(の断片)を扱える仕組みをつくれないか?

概要

GGGenome (http://GGRNA.dbcls.jp/genome/) のトップページを参照。

BH12.12での作業

メンバー

  • 内藤
個人用ツール